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基因敲除狗是怎么造出來的

來源:網(wǎng)絡(luò)

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日期:2025-03-06 03:36:18

  近日,中國科學(xué)家利用基因編輯技術(shù)——CRISPR/Cas9,對抑制狗骨骼肌生長的基因(MSTN)進行了敲除,培育出兩只肌肉發(fā)達的“大力神”狗,成功構(gòu)建了世界首個基因敲除狗模型。

  科研人員所使用的“基因編輯技術(shù)”,顧名思義,能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現(xiàn)對特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技術(shù)自問世以來,就有著其它基因編輯技術(shù)無可比擬的優(yōu)勢,技術(shù)不斷改進后,更被認為能夠在活細胞中最有效、最便捷地“編輯”任何基因。

  這不是CRISPR/Cas9這項明星技術(shù)第一次得到人們的關(guān)注。在此之前,有著“豪華版”諾獎之稱的“2015年度生命科學(xué)突破獎”頒發(fā)給了發(fā)現(xiàn)基因組編輯工具“CRISPR/Cas9”的兩位美女科學(xué)家——珍妮弗?杜德娜和艾曼紐?夏邦杰。二人更是獲得了2015年度化學(xué)領(lǐng)域的引文桂冠獎——素有諾獎“風(fēng)向標”之稱,曾被認為是今年諾貝爾化學(xué)獎的最有力競爭者。

  那CRISPR/Cas9到底是一項什么技術(shù),為何能夠獲得如此這般青睞,又何以在短短兩三年時間內(nèi),發(fā)展成為生物學(xué)領(lǐng)域最炙手可熱的研究工具之一,并有近700篇相關(guān)論文發(fā)表?它將來又會如何影響到我們的生活?

  CRISPR/Cas9是繼“鋅指核酸內(nèi)切酶(ZFN)”、“類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶(TALEN)”之后出現(xiàn)的第三代“基因組定點編輯技術(shù)”。與前兩代技術(shù)相比,其成本低、制作簡便、快捷高效的優(yōu)點,讓它迅速風(fēng)靡于世界各地的實驗室,成為科研、醫(yī)療等領(lǐng)域的有效工具。

  CRISPR/Cas9技術(shù)的靈感來源于細菌的一種獲得性免疫系統(tǒng)。與哺乳動物的二次免疫應(yīng)答類似,細菌在抵抗病毒或外源質(zhì)粒入侵時,會產(chǎn)生相應(yīng)的“記憶”,來抵抗該種外源遺傳物質(zhì)的再次入侵,而這種獲得性免疫正是由細菌的CRISPR/Cas系統(tǒng)實現(xiàn)的。

  其中的“間隔序列”來源于病毒或外源質(zhì)粒的一小段DNA,是細菌對這些外來入侵者的“記錄”。(如圖A所示)。

  病毒或外源質(zhì)粒上,存在“原間隔序列”,“間隔序列”正是與它們互相對應(yīng)。“原間隔序列”的選取并不是隨機的,這些原間隔序列的兩端向外延伸的幾個堿基往往都很保守,我們稱為PAM(Protospacer adjacent motifs-原間隔序列臨近基序)。

  當(dāng)病毒或外源質(zhì)粒DNA首次入侵到細菌體內(nèi)時,細菌會對外源DNA潛在的PAM序列進行掃描識別,將臨近PAM的序列作為候選的“原間隔序列”,將其整合到細菌基因組上CRISPR序列中的兩個“重復(fù)序列”之間。這就是“間隔序列”產(chǎn)生的過程。

  當(dāng)外源質(zhì)粒或病毒再次入侵宿主菌時,會誘導(dǎo)CRISPR序列的表達。同時,在CRISPR序列附近還有一組保守的蛋白編碼基因,稱為Cas基因。CRISPR序列的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物CRISPR RNA和Cas基因的表達產(chǎn)物等一起合作,通過對PAM序列的識別,以及“間隔序列”與外源DNA的堿基互補配對,來找到外源DNA上的靶序列,并對其切割,降解外源DNA。這也就實現(xiàn)了對病毒或外源質(zhì)粒再次入侵的免疫應(yīng)答。

  正是基于細菌的這種后天免疫防御機制,CRISPR/Cas9技術(shù)應(yīng)運而生,從而使科學(xué)家們利用RNA引導(dǎo)Cas9核酸酶實現(xiàn)對多種細胞基因組的特定位點進行修飾。

  在CRISPR/Cas9技術(shù)中,我們把即將被編輯的細胞基因組DNA看作病毒或外源DNA?;蚓庉嫷膶崿F(xiàn)只需要兩個工具——向?qū)NA(guide RNA, gRNA)和Cas9蛋白。

  其中,向?qū)NA的設(shè)計并不是隨機的,待編輯的區(qū)域附近需要存在相對保守的PAM序列(即三堿基序列NGG,其中N可以是任意堿基),而且向?qū)NA要與PAM上游的序列堿基互補配對。以基因敲除為例,如圖3所示,在待敲除基因的上下游各設(shè)計一條向?qū)NA(向?qū)NA1,向?qū)NA2),將其與含有Cas9蛋白編碼基因的質(zhì)粒一同轉(zhuǎn)入細胞中,向?qū)NA通過堿基互補配對可以靶向PAM附近的目標序列,Cas9蛋白會使該基因上下游的DNA雙鏈斷裂。

  對于DNA雙鏈的斷裂這一生物事件,生物體自身存在著DNA損傷修復(fù)的應(yīng)答機制,會將斷裂上下游兩端的序列連接起來,從而實現(xiàn)了細胞中目標基因的敲除。

  而DNA片斷的插入或定點突變的實現(xiàn),只需在此基礎(chǔ)上為細胞提供一個修復(fù)的模板質(zhì)粒,這樣細胞就會按照提供的模板在修復(fù)過程中引入片段插入或定點突變,對受精卵細胞進行基因編輯,并將其導(dǎo)入母體中,可以實現(xiàn)基因編輯動物模型的構(gòu)建。

  當(dāng)然,CRISPR/Cas9技術(shù)的成功率并非百分之百。向?qū)NA靶向序列的非特異性,以及DNA損傷修復(fù)的不確定性,都可能會導(dǎo)致基因組上其它位置產(chǎn)生未知的突變,也就是所謂的“脫靶”現(xiàn)象,這也是現(xiàn)階段影響CRISPR/Cas9技術(shù)應(yīng)用的瓶頸之一。但隨著科研人員不斷對Cas9蛋白的優(yōu)化改造,對靶基因識別特異性的增強, CRISPR/Cas9技術(shù)的“打靶”效率將不斷提高。

  CRISPR/Cas9技術(shù)在醫(yī)療健康、生產(chǎn)生活、家畜育種等領(lǐng)域的應(yīng)用,不斷取得喜人的新成果。

  如在醫(yī)療健康領(lǐng)域,用iPS細胞(誘導(dǎo)多能干細胞)治療人類的鐮刀形貧血癥,可以將病人的皮膚細胞誘導(dǎo)成iPS細胞,利用CRISPR/Cas9技術(shù)介導(dǎo)同源重組來修復(fù)發(fā)生突變的血紅蛋白基因,再將修復(fù)的iPS細胞定向誘導(dǎo)分化為造血干細胞移植到病人體內(nèi)。此外,像使用CRISPR技術(shù)根除HIV病毒、誘導(dǎo)宮頸癌細胞自我毀滅、kaiyun全站網(wǎng)頁版登錄構(gòu)建癌癥模型等最新成果先后被Nature等著名雜志所報道。在奶制品的發(fā)酵中,利用CRISPR/Cas9增強發(fā)酵菌株對噬菌體的防御能力;在家畜育種方面,也正在利用基因編輯工具通過對顯著影響家畜生產(chǎn)性能的基因位點進行改良,以實現(xiàn)豬、牛、羊等大型家畜生產(chǎn)性能的提高等。

  但正如科學(xué)是把雙刃劍,任何新技術(shù)的出現(xiàn)都少不了其反對者的存在,在CRISPR/Cas9技術(shù)得到熱烈呼聲的同時,不少人也對它提出了質(zhì)疑,特別是對其脫靶事件可能導(dǎo)致基因組其他位置產(chǎn)生未知突變表示擔(dān)憂。

  作為生命科學(xué)領(lǐng)域的一項重大突破,筆者認為CRISPR/Cas9的創(chuàng)新性、技術(shù)性毋庸置疑,隨著對CRISPR系統(tǒng)認識的加深,實驗設(shè)計的優(yōu)化改造,相信其打靶效率會進一步提高,CRISPR/Cas9以及其衍生技術(shù)終究會帶來一場科學(xué)史上的巨大變革。期待在不久的將來,CRISPR/Cas9所帶來的巨大轉(zhuǎn)變必將能夠惠澤萬家,到時候?qū)儆谒闹Z獎終將到來。

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